Tipologia unità: Unità Operativa Complessa
Sede: 1° piano Padiglione Baglivi, Istituto Nazionale Malattie Infettive Lazzaro Spallanzani
Responsabile: Prof. Fabrizio Maggi (fabrizio.maggi@inmi.it / 06 55170914)
Segreteria: segreviro@inmi.it / 06 55170690
Personale: Dirigenti biologi, Tecnici di Laboratorio; Personale di supporto
La U.O.C. Laboratorio di Virologia e Laboratori di Biosicurezza è certificata secondo la norma UNI EN ISO 9001:2015 per le attività diagnostiche e per la gestione dei laboratori di biosicurezza e relativa attività di formazione. È una struttura altamente specializzata a cui afferiscono due laboratori che svolgono attività collegate allo sviluppo di protocolli diagnostico-terapeutici e quattro laboratori di alto contenimento (tre di livello BSL3 e uno di BSL4), può contare su una dotazione strumentale di altissimo livello ed è impegnata a garantire in h24 prestazioni di altissimo livello anche in tema di diagnostica d’urgenza per l’effettuazione di analisi rivolte all’accertamento della sicurezza dei trapianti e per l’effettuazione di accertamenti microbiologici urgenti.
Il Laboratorio è riferimento della Comunità Europea per la diagnosi d’infezione da virus zoonotici emergenti, fa parte del GHSAG Laboratory Network ed è riferimento nazionale per la diagnosi virologica avanzata e per la diagnosi d’infezione di patogeni di livello 3 e 4. Coordina la rete dei laboratori regionali per il monitoraggio e il sequenziamento dell’infezione da SARS-CoV-2 ed è laboratorio di riferimento regionale per la diagnosi e la sorveglianza di molte infezioni virali. Il suo personale è consulente WHO, del Ministero della Salute, del Ministero degli Affari Esteri e di altri enti sovranazionali. Il Laboratorio di Virologia partecipa regolarmente a programmi per la verifica esterna della qualità dei test diagnostici e contribuisce attivamente a programmi di controllo e allo sviluppo e standardizzazione di processi legati alla qualità delle attività di laboratorio.
Il menù delle prestazioni diagnostiche virologiche è costantemente aggiornato con l’introduzione di sempre nuove analisi e l’aggiornamento dei metodi. Il repertorio di analisi virologiche classiche e molecolari dedicato ai virus emergenti è fra i più completi in Italia ed è frutto del trasferimento al campo assistenziale dell’attività di ricerca svolta dal laboratorio. Le attività diagnostiche svolte comprendono 1. esami di siero-immunologia infettiva per la ricerca della risposta anticorpale antivirus; 2. ricerca diretta di virus con metodiche molecolari e saggi antigenici. I metodi molecolari utilizzati comprendono anche metodi non commerciali, non disponibili presso altri laboratori; 3. caratterizzazione molecolare, tipizzazione e ricerca di mutazioni conferenti resistenza agli antivirali attraverso sequenziamento parziale e/o completo del genoma virale; 4. isolamento di virus in vitro su colture cellulari di tipo 2D e 3D e test di siero-neutralizzazione, anch’essi peculiari rispetto a strutture convenzionali perché eseguibili in strutture di alto contenimento; 5. analisi ed elaborazioni bioinformatiche dei dati di sequenziamento.
Il Laboratorio è parte di reti formative ed accoglie studenti in formazione specialistica iscritti alla Scuola di Specializzazione in Microbiologia e Virologia e studenti per lo svolgimento di tirocini e Tesi di Laurea e Dottorato.
Unità Operativa Semplice: UOS Sequenziamento: è’ una struttura altamente specializzata di ricerca e diagnostica dedicata all’analisi e caratterizzazione dei genomi dei patogeni virali attraverso l’utilizzo di tecnologie e piattaforme di sequenziamento all’avanguardia (Sanger, NGS, Metagenomica Virale).
Sezioni specialistiche:
- Virologia molecolare
- Viro-immunologia infettiva
- Laboratori per isolamento virale (BSL2, colture 2D, 3D e organoidi),
- Laboratori di alto contenimento (BSL3 e BSL4) per patogeni di gruppo 3 e 4,
- Sezione urgenze in h24
- Advanced Virology Assays (Sviluppo, standardizzazione di sistemi diagnostici innovativi per la diagnosi di infezioni virali)
- Viral biomarkers (identificazione e validazione di nuovi biomarcatori virali di salute e malattia)
- Virome Virology (caratterizzazione del viroma umano e sue relazioni con lo sviluppo di malattie complesse, croniche trasmissibili e non)
- Systems Virology (studio dei meccanismi di trasmissione, risposte dell’ospite all’infezione, ruolo di proteine e networks cellulari sull’infezione e replicazione virale)
- Cloning Virology: sviluppo di metodologie atte alla produzione di pseudovirus/cloni virali allo scopo di sviluppare nuovi approcci diagnostici, vaccini e terapie.
Attività fornite come Laboratorio di Riferimento:
- Laboratorio di Riferimento Regionale per la diagnosi umana di arbovirosi
- Laboratorio di Riferimento Regionale per la diagnosi d’infezione da virus delle scimmie (monkeypox)
- Laboratorio di Riferimento Regionale per le Infezioni nei trapianti
- Laboratorio di Riferimento Regionale per la diagnosi molecolare di SARS-CoV-2
- Laboratorio di Riferimento Regionale per le forme gravi e complicate di influenza stagionale
- Laboratorio di Riferimento Regionale per il sistema di sorveglianza relativo al morbillo e rosolia
- Laboratorio di Riferimento Regionale per la diagnosi di epatiti virali acute A/B/C
- Laboratorio di Riferimento Regionale per la diagnostica delle epatiti virali a trasmissione oro/fecale HAV, HEV
- Laboratorio di Riferimento Regionale per la diagnosi delle sindromi neuroinfettive acute
- Laboratorio di Coordinamento Regionale della rete SARL per il Giubileo 2025
- Laboratorio di Riferimento Nazionale per Ebola
- Laboratorio di Riferimento Nazionale per la diagnosi di Febbri Emorragiche Virali
- Laboratorio di Riferimento Nazionale per SARS-CoV-1
- Laboratorio di Riferimento Nazionale per la diagnosi di patologie derivanti da possibili attacchi bioterroristici
- Laboratorio di Riferimento Europeo per la diagnosi di Patogeni Virali Emergenti, Zoonotici e Veicolati da Roditori
Istruzioni e moduli per l’invio di campioni:
1. Sinottico Esami VIRO 2024 agg 07-24
2. Elenco_esami_VIROLOGIA agg. 07-24
3. Allegato A2 per attività diagnostica 2025
4. Scheda Richiesta dati per diagnosi infezione HIV
5. Scheda Farmacoresistenza HIV
6. Scheda Farmacoresistenza HBV
7. Scheda Farmacoresistenza HCV
8. Scheda Farmacoresistenza CMV
9. Scheda Sorveglianza Epatiti A ed E
10. Guida pratica utente VIRO 07-2024
11. Scheda Sorveglianza_WNV e USUV
12. Scheda Sorveglianza Arbovirosi (escluso WNV e USUTU)
13. Scheda Sorveglianza per sindromi neurologiche di sospetta origine infettiva_sez A-B_H
TARIFFARIO ISTITUZIONALE
Unit Type: Division of Virology
Location: 1st floor, Baglivi Building, National Institute for Infectious Diseases Lazzaro Spallanzani
Head: Prof. Fabrizio Maggi (fabrizio.maggi@inmi.it/06 55170914)
Secretariat: segreviro@inmi.it/06 55170690
Staff: biologists, laboratory technicians, support staff
The Unit of Laboratory of Virology and Biosafety Laboratories is certified according to the UNI EN ISO 9001:2015 standard for diagnostic activities and the management of biosafety laboratories and related training activities. It is a highly specialized structure that includes two laboratories involved in the development of diagnostic-therapeutic protocols and four high-containment laboratories (three BSL3 and one BSL4). It boasts top-level equipment and is committed to providing high-level services 24/7, including urgent diagnostics for transplant safety and urgent microbiological assessments.
The Laboratory is a reference point for the European Community for the diagnosis of emerging zoonotic virus infections, is part of the GHSAG Laboratory Network, and is a national reference for advanced virological diagnosis and the diagnosis of level 3 and 4 pathogen infections. It coordinates the network of regional laboratories for monitoring and sequencing SARS-CoV-2 infection and is the regional reference laboratory for the diagnosis and surveillance of many viral infections. Its staff serves as consultants for WHO, the Ministry of Health, the Ministry of Foreign Affairs, and other supranational entities.
The Virology Laboratory regularly participates in external quality assessment programs for diagnostic tests and actively contributes to control programs and the development and standardization of processes related to laboratory activity quality. The menu of virological diagnostic services is constantly updated with the introduction of new analyses and the updating of methods. The repertoire of classical and molecular virological analyses dedicated to emerging viruses is among the most comprehensive in Italy and is the result of the transfer of research activities conducted by the laboratory to the clinical field.
The diagnostic activities performed include: 1. infectious sero-immunology tests for the detection of antiviral antibody response; 2. direct virus detection using molecular methods and antigen assays. The molecular methods used also include non-commercial methods not available in other laboratories; 3. molecular characterization, typing, and detection of mutations conferring antiviral resistance through partial and/or complete sequencing of the viral genome; 4. in vitro virus isolation on 2D and 3D cell cultures and serum-neutralization tests, which are also unique compared to conventional structures as they can be performed in high-containment facilities; 5. bioinformatic analysis and processing of sequencing data.
The Laboratory is part of training networks and hosts students in specialized training enrolled in the School of Specialization in Microbiology and Virology, as well as students for internships and theses and doctoral research.
Sequencing Unit (UOS): it is a highly specialized research and diagnostic facility dedicated to the analysis and characterization of viral pathogen genomes using cutting-edge sequencing technologies and platforms (Sanger, NGS, Viral Metagenomics).
Specialized Sections:
- Molecular Virology
- Infectious Viro-Immunology
- Laboratories for Viral Isolation (BSL2, 2D, 3D, and Organoid Cultures)
- High-Containment Laboratories (BSL3 and BSL4) for Group 3 and 4 Pathogens
- 24/7 Emergency Section
- Advanced Virology Assays (Development and standardization of innovative diagnostic systems for viral infections)
- Viral Biomarkers (identification and validation of new viral biomarkers of health and disease)
- Virome Virology (Characterization of the human virome and its relationship with the development of complex, chronic, transmissible, and non-transmissible diseases)
- Systems Virology (study of transmission mechanisms, host responses to infection, and the role of proteins and cellular networks in viral infection and replication)
- Cloning Virology (Development of methodologies to produce pseudoviruses/viral clones to develop new diagnostic approaches, vaccines, and therapies)
Activities provided as a Reference Laboratory:
- Regional Reference Laboratory for Human Arbovirus Diagnosis
- Regional Reference Laboratory for Monkeypox Virus Infection Diagnosis
- Regional Reference Laboratory for Transplant Infections
- Regional Reference Laboratory for Molecular Diagnosis of SARS-CoV-2
- Regional Reference Laboratory for Severe and Complicated Seasonal Influenza
- Regional Reference Laboratory for Measles and Rubella Surveillance System
- Regional Reference Laboratory for Acute Viral Hepatitis A/B/C Diagnosis
- Regional Reference Laboratory for Oro/Fecal Transmission Viral Hepatitis HAV, HEV Diagnosis
- Regional Reference Laboratory for Acute Neuroinfectious Syndromes Diagnosis
- Regional Coordination Laboratory of the SARL Network for the Jubilee 2025
- National Reference Laboratory for Ebola
- National Reference Laboratory for Viral Hemorrhagic Fevers Diagnosis
- National Reference Laboratory for SARS-CoV-1
- National Reference Laboratory for Diagnosis of Diseases from Potential Bioterrorist Attacks
- European Reference Laboratory for Diagnosis of Emerging, Zoonotic, and Rodent-Borne Viral Pathogens